Un poco más sobre nosotras...

El ABC de Mundo Bioquímica

Después de un largo e intenso brainstorming con diferentes ideas para hacer esta entrada, encontramos la mejor manera de resumir todo el trabajo del año en el blog y en el aula. Queríamos que esta entrada refleje nuestras opiniones, que represente el esfuerzo que nos llevo hacer los trabajos en el blog y contar un poco sobre lo que fue el año. En este ABC buscamos resumir todo esto en una forma sencilla y divertida:

A: Analogías
Analogías referidas a cosas cotidianas, como otra forma de entender conceptos difíciles.

B: Bioenergética
Pudimos resumir a la Bioenergética como: usos y transferencia de la energía en sistemas biológicos.

C: Chocolate
En “Química con Chocolates” es la forma más rica y divertida para hacer glucólisis, entendimos que la glucosa que obteníamos del chocolate nos da energía para poder estar más atentos.

D: Debate!
Una clase diferente con fiscales y jueces muy divertida en la que discutimos acerca de los Lípidos.

E: Entradas
Cada post de nuestro blog es una entrada de temas que fuimos viendo durante el año. Los contenidos de las entradas son accesibles y entendibles para que todos podamos repasar leyendo cada una de ellas.

F: FAD
Es una coenzima, al igual que el NAD, fundamental en muchas reacciones.

G: Glucosa

Es un hidrato de carbono, monosacárido que aporta energía a nuestro organismo y que cumple un papel fundamental en nuestros metabolismos y participa en muchas vías metabólicas que son importantísimas para que nuestras células puedan funcionar.

H: Hashtags
A lo largo de todo el año las entradas que fuimos subiendo al blog iban acompañadas de diferentes #Hashtags para encontrar mas rápido las diferentes entradas. #QB4B2014

I: Inglés
Para variar un poco la costumbre, tuvimos una clase de Bioquímica en Inglés sobre la Cadena respiratoria, explicada por la teoría quimiostática.

J: Jose
Desde el primer dia de clases me dí cuenta que esta materia iba a ser distinta a las otras, con esto no me refiero a los contenidos sino a la forma de dar la materia, ya que ninguna clase era igual a la otra, siempre Pablo traía ideas distintas, lo que hacía las clases super dinámicas. 

K: Krebs
Como aprendimos dentro de #ViasMetabolicas, el ciclo de Krebs es una vía metabólica que se cumple dentro de las mitocondrias y cuyo principal objetivo es la obtención de energía (ATP).

L: Lípidos
Son macromoléculas insolubles en agua, solubles en solventes orgánicos. Se los encuentra en las membranas celulares, en el material de reserva energética, tienen función nutritiva y también se encuentran en hormonas sexuales, vitaminas y ácidos biliares.

M: Montse
Desde que empecé el año siempre busco maneras creativas de estudiar bioquímica, desde cartulinas en el placard hasta pasarme la noche con la cadena respiratoria y 1 kg de helado. Hacer este blog me ayudó a buscar nuevas ideas.

N: Nucleótidos
Estos son los "ladrillos" que conforman a los ácidos nucleicos. Además podemos decir que están compuestos por: una base nitrogenada, una aldopentosa y un ácido fosfórico.

O: Oxidación
La pérdida de un protón. Es la reacción complementaria a la reducción.

P: Pablo
La letra de Pablo, de Paul. Un profesor que este año logró que nos superáramos nosotros mismos, hagamos más de lo que nosotros nos creíamos posible de hacer. Nos enseñó a estudiar, nos enseñó química y muchas cosas más. Gracias a él por este blog!

Q: Química
Nosotros estudiamos a la Bioquímica, ciencia encargada de estudiar los procesos químicos que ocurren dentro de los seres vivos.

R: Rayu
Gracias a las variaciones que se hicieron de lo que es "una clase normal-común" se pudo hacer un aprendizaje diferente, entretenido, que facilitó que los temas no solo se escuchen , sino que se entiendan, queden en la cabeza y se puedan relacionar, pensar y analizar. Me gustaría decir también que fue muy divertido poder hacer las cosas en grupo y no algo individual.

S: Salir del aula
Como todos ya saben, no formamos parte de una escuela muy convencional y tenemos la posibilidad de los días lindos poder ir afuera a trabajar juntos en grupo, aprendiendo por ejemplo del Ciclo de Krebs.

T: Trabajos prácticos: organización como grupo
Un tipo de actividad que creemos que en general costó bastante es el tema de los Trabajos Prácticos dentro de los blogs. Encontramos diferentes obstáculos, pero creemos que todos los grupos lograron superarlos.

U: Ubiquinona
Como palabra graciosa y enzima que forma parte de la cadena respiratoria.

V: Valen
Aca yo, Valen, les soy sincera y les digo, que en los 3 años que tuvimos química, nunca fue mi materia preferida. Este año, si bien sigue sin gustarme, encontre la forma de hacer que no sea pesada y de no protestar cada vez que tengo que estudiar, o cada vez que teníamos que postear algo en el blog. En bioquímica aprendí a divertirme estudiando una materia que nunca me gustó...

W: Wikipedia y la fotosíntesis
Normalmente nadie confía en Wikipedia. Sin embargo, Pablo nos contó que el artículo de Wikipedia sobre la fotosíntesis es más largo y completo que el del libro cuyo capítulo sobre fotosíntesis “era el más extenso”.

X: Reacciones eXergónicas y endergónicas
Aprendimos que las reacciones pueden ser exergónicas o endergónicas. Las exergónicas son las que son más probables de ocurrir, mientras que las endergónicas son reacciones que son más difíciles de ocurrir.

Y: Yeyé
Quiero contar algo que me resultó gracioso todo el año sobre Pablo, es que a mi, Ayelén, me apodan Yeye, pero desde la primera clase él me dice Yeyé, y me parece super tierno, porque en el club, los mas chiquitos me dicen igual.

Z: Zipper
La palabra con Z que cierra nuestro ABC, como el zipper o cierre de las camperas.

Esperamos que les guste este cierre previo a fin de año, y que las entradas hayan sido de ayuda.
La seguimos!!
Salu2,
MundoBioquimica

Respiratory Chain

Peter Mitchell came up with the Chemiosmotic theory in 1964. It says that the energy released by the electron transport is used to pump protons from the matrix to the intermembrane space. The protons are pumped through existing transporters, which are located between enzyme complexes on the membrane of the mitochondria. For this reason an electrochemical proton gradient is formed and it performs what is known as protonmotriz force, because when the protons pass through and enter again  the inner membrane, they do it through the ATP synthase, which is in such membranes. The protonmotriz energy is turned into binding energy in ATP molecules.  

Respiratory Chain

El último viernes 10 de Octubre tuvimos algunas de nosotras una clase de quimica en ingles, sobre la Cadena Respiratoria, como tarea teniamos que escribir un párrafo sobre la teoría quimiosmótica de Mitchell.
Are you ready? Here we go...
This theory explains how the energy from electron transport is used to produce ATP. By the Proton Pump the electron transport is coupled to the transport of H+ across the inner mitocondrial membrane from the intermembrane space. This process creates an electrical gradient (more positive charges outside the membrane) and a Ph gradient (more acidic Ph outside the membrane). All this energy generated by this gradient is inaff for the synthesis of ATP.

We hope you like this... Ayelen and Valentina

La cadena respiratoria

Como ya aprendimos, la cadena respiratoria es el ultimo paso de la respiración celular, en el que finalmente se degradan todas las coenzimas (NAD+ y FAD+).

La podemos definir como vía metabólica con diferentes pasos o etapas, cuyos objetivos son obtener ATP y re-oxidar el NAD+ y el FAD+. 

También, podemos entenderla como un conjunto de aceptores y transportadores de equivalentes de reducción (protones y electrones), que trabajan en TODAS las mitocondrias, aunque únicamente en su membrana mitocondrial interna.

A continuación les dejamos un vídeo, creado por nosotras, para que comprendan mas como trabaja esta vía. Esperamos que les sirva...

Dandole la vuelta al ciclo de Krebs

Dame la mano y vamos a darle la vuelta al ciclo!
El ciclo de krebs, del ácido cítrico o de ácidos tricarboxílicos es una vía metabólica, que se cumple íntegramente dentro de las mitocondrias y cuyo objetivo es la obtención de energía.
Esta vía tiene como alimentador del ciclo al Acetil-CoA, este es el que inicia las reacciones combinandose con oxalacetato.

Características del ciclo de krebs:

• Exergónica
• Catalítica: es decir que produce sus propios sustratos
• Es netamente aeróbica
• Anfibólica 

Reacciones:

1. Formación de ácido cítrico: la unión de Acetil-CoA y oxalacetato, y la participación de la enzima citrato sintasa (es regulatoria, inhibida por ATP), dan como resultado citrato. Esta es una reacción irreversible
2. Formación de isocitrato: por isomerización es citrato se convierte en isocitrato, mediante 2 pasos. primero se deshidrata a cisaconitatoo y luego recupera agua y forma isocitrato. En esta reacción actúa la enzima aconitasa.
3. Oxidación de isocitrato: el isocitrato es deshidrogenado para convertirse en oxalsuccinato. Esta reacción es catalizada por la enzima isocitrato deshidrogenasa (oxidorreductasa, tiene al NAD como coenzima, es alostérica aumenta con ADP y es inhibida por ATP y NADH)
4. Descarboxilación de oxalsuccinato: la isocitrato deshidrogenasa (reguladora, inhibida por ATP y NADH+H+ cataliza la descarboxilación de oxalsuccinato para dar alfa-ceto-glutarato
5. Descarboxilación oxidativa de alfa-ceto-glutarato: En esta reacción actúa un sistema multienzimático, llamado complejo alfa-cetoglutarato deshidrogenasa ( reguladora, inhibida por NADH+H+) que posee 3 enzimas y 5 coenzimas. Se forma succinil-CoA. Es exergónica y prácticamente irreversible
6. Formación de succinato: la succinato-CoA es convertida en succinato y CoA, por acción de succinato tioquinasa (única etapa del ciclo en la cual se genera una unión fosfato de alta energía
7. Deshidrogenación de succinato: succinato es oxidado a fumarato por la succinato deshidrogenasa (específica, firmemente unida a la membrana interna de la organela e inhibida por oxalacetato)
8. Hidratación de fumarato: por adición de agua el fumarato se convierte en malato y es catalizada por la fumarato hidratasa.
9. Oxidación del malato: el malato pierde dos hidrógenos y se transforma en oxaloacetato. Catalizada por la malato deshidrogenasa. Es una reacción endergónica, y la cual cierra el ciclo, ya que el oxalacetato es el compuesto final e inicial.

En una vuelta completa se libera dos moléculas de CO2 y ocho átomos de hidrógeno.

El balance energético del ciclo del ácido cítrico es:
Isocitrato→ Oxalsuccinato                (NADH)    3 mol ATP
Alfa-cetoglutarato→ Succinil-CoA   (NADH)    3 mol ATP
Succinil-CoA→ Succinato                                   1 mol ATP
Succinato→ Fumarato                       (FADH2)   2 mol ATP
Malato→ Oxaloacetato                      (NADH)     3 mol ATP
                                                                   total     12 mol ATP
El total es de 12 ATP, pero como la glucosa origina dos acetatos, en realidad se forman 24 ATP

Pero ahora para hacer una explicacion mas sencilla, podemos usar algunas analogias como:

1. El edificio : 
   • Un inversor necesita dinero (Acetil-CoA) y materiales (oxalacetato), como también la participación de la mano de obra (enzima citrato sintetasa) para hacer la estructura de un edificio (citrato).
   Aunque a veces los obreros, no tenían ganas de trabajar porque hacía mucho calor (ATP), pudieron terminar de construirla (citrato).
   Inesperadamente hubo una fuerte ráfaga de viento que dobló parte de la estructura (isomerización). Algunas de las maderas se volaron (cisaconitato),pero llegaron los obreros con sus martillos (enzima aconitasa) y pudieron reacomodarlas (isocitrato). (REACCION UNO Y DOS)
2. Bajar de peso : 
   • Una chica (isocitrato), quería bajar de peso (oxidarse) para convertirse en modelo (oxalsuccinato). Por eso llamó a un personal trainer para que la ayudara (enzima isocitrato deshidrogenasa).
   Los días soleados (ADP), el personal trainer llevaba a un colega para que lo ayude (NAD) y que juntos le puedan explicar a la chica más ejercicios.
   Mientras que los días nublados (ATP Y NADH), se suspendía el entrenamiento.
   Finalmente la chica logró bajar de peso (oxidarse), y convertirse en modelo (isocitrato), pero aún así no estaba conforme. Se quiso realizar una cirugía estética (descarboxilarse), para ser mucho más bella (alfa-ceto-glutarato). Al cirujano (enzima isocitrato deshidrogenasa) lo controlaba: la mama (NADH+H+) y el padre de la chica (ATP). (REACCION TRES Y CUATRO)
3. Cutis perfecto : 
   • Una mujer, quería recomponer su cutis (alfa-ceto-glutarato). Para esto utilizó varias mascarillas (complejo alfa-cetoglutarato deshidrogenasa). Una de barro, otra de aceite de almendras y otra de aloe vera (las tres enzimas), y todas tenían vitaminas A, B, C, E y minerales (coenzimas). Su cutis se había rehidratado (Succinil-CoA). Pero debía quitarse las mascarillas, por eso su hermana (enzima succinato tioquinasa) la ayudó. Tenía una nueva cara (succinato)  ( REACCION CINCO Y SEIS)
4. El estudio : 
   • Juan, un estudiante (Succinato) de la UBA, tuvo que estudiar para todos sus parciales presionado por su novia (enzima succinato deshidrogenasa). El jóven se estresó (se oxidó), pero para evitar esto tomaba tranquilizantes que impedían que llegue a esa situación (oxalacetato). Finalmente, terminó la época de parciales y se convirtió en un chico nuevo y relajado (fumarato). A los dos meses, llega la nueva época de exámenes (adición de agua) y su novia (fumarato hidratasa), lo seguía presionando. El chico no se estresa, se pone neurótico (malato). Luego de terminadas las dos épocas de parciales (enzima malato deshidrogenasa), el joven pierde sus dos grados de locura (dos hidrógenos) y se transforma en un Juan más alegre y pacífico (oxaloacetato), compartiendo su energía positiva hacia el resto de sus amigos (reacción endergónica) (REACCION SIETE OCHO Y NUEVE)
5. Ordenando los libros : 
   
   • Una chica decide re acomodar su biblioteca (libros= oxalacetato), pero se da cuenta que necesita más espacio , entonces decide poner un nuevo estante. Para seleccionar los libros, le pide ayuda a su madre(citrato sintasa) que como sorpresa le compra más libros (Acetil coA); entonces acomoda el estante con los libros nuevos y los que ya no entraban (citrato). En la tarde, su hermano (aconitasa) entra al cuarto y cambia de lugar los libros del estante formando un nuevo orden (isocitrato). Después el papá (isocitrato deshidrogenasa) le regala un señalador (NAD) y le pide un libro prestado (hidrogeno), una revista (NADH) y una enciclopedia (CO2) y lo saca del estante, quedando otro orden de libros (alfa-cetoglutarato). Más tarde su hermana (complejo alfa.cetoglutarato deshidrogenasa) decide darle uno de sus libros y un separador (NAD y CoA) si en cambio ella le daba lo mismo que al padre (NAD,H y CO2) dejando una vez mas otro orden en el estante (Succinil-CoA). En el fin de semana la chica ve un libro y decide comprarlo (GDP) pero la vendedora (Succinil-CoA sintetasa) le dice que hay una promoción y se puede llevar el libro con en CD de la película (GTP), es así que los compra y los guarda en el estante (Succinato). Cuando tiene que estudiar para un examen(FAD) agarra los dos libros correspondientes (FADH2) y se da cuenta que eran de la biblioteca de la escuela y los tenía que devolver(succinato deshidrogenasa), dejando solo algunos libros en su estante (Fumarato). Debajo de la cama encuentra su libro de biología (H2O) y lo agrega (Fumarasa) al estante (malato). De repente algo (NAD) le cae en la en la cabeza y mientras se agacha (malato deshidrogenasa) para agarrarlo y sacar dos cuadernos (NAD +H) para poder guardarlo en el estante se da cuenta que todo fue un sueño y su biblioteca está como antes (oxalacetato) (TODAS LAS REACCIONES)

 Esperamos que les sea útil y divertido, como fue para nosotras hacerlo...

Por Un Chocolate

A pesar de no notar nada, nuestro organismo es una máquina que trabaja constantemente. En Química con Chocolates vimos como un poco de chocolate puede tener muchísimos destinos gracias a las vías metabólicas. En el caso de la glucogenogénesis, a partir de glucosa que ingerimos formamos glucógeno. La vía metabólica pentosa-fosfato produce a partir de glucosa NADPH + H+ y ribosa para la síntesis de nucleótidos. Cuando hay niveles bajos de glucosa (no comemos hace varias horas) el glucógeno es degradado rápidamente a glucosa por acción enzimática en la vía Glucogenolisis. Por último, la vía metabólica gluconeogénesis sintetiza glucosa a partir de fuentes no glucocídicas. Hay muchos caminos que un chocolate puede recorrer antes de que lo usemos!